توکلی در نامه‌ای سرگشاده از سه وزیر خواست برای اجرای عادلانه کنکور اقدام مناسب‌تری انجام دهند.
توکلی همچنین بار دیگر خواستار دادن حق انتخاب دفترچه سؤالات برای داوطلبان نظام قدیم شد.
متن این نامه بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
برادر ارجمند جناب آقای دکتر منصور غلامی؛ وزیر محترم علوم، تحقیقات و فناوری
برادر ارجمند جناب آقای دکتر سعید نمکی؛ وزیر محترم بهداشت، درمان و آموزش پزشکی
برادر ارجمند جناب آقای دکتر سید جواد حسینی؛ سرپرست محترم وزارت آموزش‌وپرورش
سلام علیکم
پس از اعلام مصوبه شورای سنجش و پذیرش دانشجو مبنی بر تأثیر قطعی نمرات امتحان نهایی در آزمون سراسری سال ۹۸، دیده‌بان شفافیت و عدالت به تقاضای ده‌ها هزار داوطلب کنکور که به این مصوبه اعتراض داشتند، موضوع را بررسی و ناعادلانه بودن آن را تأیید کرد؛ همچنین در مورد پیامدهای خطیر اجتماعی و امنیتی آن هشدارهای لازم را به مسئولان مربوط اعلام داشت. دیدار با وزیر وقت آموزش‌وپرورش، نامه بیش از ۱۷۰ نماینده مجلس در اعتراض به این مصوبه، صدور بیانیه دیده‌بان، نامه‌نگاری با رئیس دفتر ریاست محترم جمهور و دبیر شورای عالی امنیت ملی، از جمله این اقدامات بود. این اقدامات نهایتاً به لغو تأثیر قطعی معدل در آزمون سراسری ۹۸ انجامید.
با توجه به اینکه امسال میزان پوشش امتحانات نهایی نسبت به سال ۹۷ تغییر مثبت نداشته و حتی برگزاری امتحانات استاندارد، از دو سال به یک سال تقلیل یافته است، تمام دلایل ناعادلانه بودن تأثیر قطعی معدل در کنکور ۹۸، در کنکور سال ۹۹ نیز به قوت خود باقی است. همان‌گونه که آگاه هستید، مجلس در حال بررسی پیش‌نویس طرحی برای شیوه جدید سنجش و پذیرش دانشجو است و احتمالاً سال ۹۹ آخرین سال برگزاری کنکور به شیوه فعلی خواهد بود، بنابراین مقتضی است شورای سنجش و پذیرش دانشجو در این یک سال باقی‌مانده از قانون فعلی، از هر گونه تصمیم تنش‌زا و حساسیت‌برانگیز مانند تأثیر قطعی معدل (به هر میزان) که باعث درگیری مجدد مجلس با این موضوعات خواهد شد جلوگیری به عمل آورد و کنکور ۹۹ نیز مانند سال قبل با تأثیر مثبت معدل برگزار شود.
ضمناً خواهشمندیم مطالبه حق انتخاب دفترچه سؤالات برای داوطلبان نظام قدیم که طی نامه‌ای رسمی به رئیس محترم شورای سنجش و آموزش تقدیم شده است نیز بررسی شود.
با احترام
احمد توکلی_رئیس هیأت مدیره سازمان مردم نهاد دیده بان شفافیت و عدالت